2016年4月，慧萌软件成功取得“ISO9001质量管理体系认证”证书。

公司从2015年7月质量管理体系的立项开始，历经体系基础信息整理、体系策划与设计、体系文档编写、体系运行调整、体系内部审核直至2016年4月体系通过CNAS、IAF双认可。

该证书的取得标志着公司在整体管理，特别是计算机应用软件的设计开发与技术服务方面，计算机信息系统集成方面，完成了管理上质的飞跃。